检测项目
RNA 质量评估:主要检测 RNA 的完整性、纯度和浓度。完整性可通过琼脂糖凝胶电泳观察 RNA 条带的清晰程度和分布来判断,如是否存在明显的降解条带;纯度通常利用分光光度计检测 RNA 在 260nm 和 280nm 波长处的吸光度比值来确定,纯 RNA 的 A260/A280 比值一般在 1.8-2.0 之间;浓度则可通过分光光度计在 260nm 波长处的吸光度值结合特定的计算公式得出。
污染物检测:检测 RNA 样本中是否存在 DNA、蛋白质、有机溶剂等污染物,以确保 RNA 的质量符合后续分子诊断实验的要求。例如,若 A260/A280 比值异常,可能提示存在蛋白质或酚类等杂质;若 A260/A230 比值偏低,可能表示有盐类或有机溶剂残留。
检测范围
适用于医学实验室和分子病理学实验室进行的分子体外诊断检验,包括实验室自建检测项目,也适用于实验室客户、体外诊断开发者和制造商、生物样本库、从事生物医学研究的机构和商业组织以及监管机构。
检测仪器
切片机:用于将福尔马林固定及石蜡包埋组织切成薄片,以便进行后续的处理和 RNA 提取,如徕卡 RM2235 切片机等,可精确地切出厚度均匀的组织切片。
脱蜡设备:如组织处理仪或恒温水浴锅等,用于去除组织切片中的石蜡,使 RNA 能够更好地释放和提取。
核酸提取仪:可实现自动化的 RNA 提取过程,提高提取效率和重复性,如 Qiagen 的 QIAcube 核酸提取仪等,能根据不同的样本类型和提取方法进行程序设定。
检测方法
组织切片预处理:将福尔马林固定及石蜡包埋组织切成厚度合适的切片,通常为 5-10μm,然后将切片置于二甲苯中脱蜡,再经过梯度乙醇水化,使组织恢复到水相状态,为后续的 RNA 提取做好准备。
RNA 提取:可采用多种方法,如基于酚 - 氯仿的传统提取法、柱式提取法和磁珠提取法等。柱式提取法是利用特殊的吸附柱,在特定的缓冲液条件下,使 RNA 吸附在柱上,而杂质被洗脱,然后再用洗脱液将 RNA 从柱上洗脱下来;磁珠提取法则是利用磁珠表面的特异性基团与 RNA 结合,在磁场作用下实现 RNA 的分离和纯化。
质量检测:通过琼脂糖凝胶电泳,将提取的 RNA 在电场作用下在琼脂糖凝胶中进行分离,完整的 RNA 会呈现出清晰的条带,根据条带的亮度、完整性和大小分布来判断 RNA 的质量;还可以利用分光光度计检测 RNA 在 260nm 和 280nm 波长处的吸光度比值,纯 RNA 的 A260/A280 比值一般在 1.8-2.0 之间,比值异常则可能提示 RNA 中存在杂质。
检测标准
本标准规定了在进行分子分析之前的检验前阶段,用于 RNA 检验的福尔马林固定和石蜡包埋组织标本的处理、记录、贮存及取材的指南,以确保样本的质量和稳定性,减少因操作不当导致的样本污染和降解等。规范性引用了 GB 19781-2005《医学实验室 安全要求》、GB/T 22576《医学实验室 质量和能力的专用要求》、GB/T 27020-2016《合格评定 各类检验机构的运作要求》、ISO 15189《医学实验室 质量和能力的特殊要求》、ISO 15190《医学实验室 安全要求》等标准。